在击败枯叶道馆后他们一行人来到了一个港都。
在火箭队的忽悠下众人登上了坂木牢大举办的圣安奴号。
在经历一段战斗后圣比奴号即将沉入海底，一时间小智一行人和火箭队两人一精灵晕倒，谱尼将他们救了起来。
至于为什么要救火箭队，一是火箭队包含了宝可梦的童年乐趣之一，二是火箭队要说好他们加入了火箭队，要说坏他们又什么都没做成，本着顺路一起救了的心理一起救了上去。
只不过谱尼收了一点利息，它把小次郎的鲤鱼王偷偷拿走了，众所周知鲤鱼王很快就要被小次郎抛弃进化成暴鲤龙了，不要白不要嘛。
在经过一些奇妙旅行后，小智一行人以金黄市的金黄道馆前进。
途中小智一行人遇到了巴大碟群，在此小智的巴大碟见到了自己的心仪的对象，粉色巴大碟。
不过粉色的巴大碟并不喜欢它，这让它一度陷入了自卑。
在小智等人的鼓励下它振作精神，重新求爱。
突然，火箭队神助攻来了。
一个照面将成群的巴大碟抓捕。
而巴大碟心仪的对象也在被抓之列，巴大碟燃起斗志面对火箭队的攻击，巴大碟奋不顾身击败了对方，这样的勇敢终于打动了粉色蝴蝶。
至此小智在夕阳的余晖中做出了决定，他要让巴大碟追寻自己的生活与自由。
在告别巴大碟后，小智正式挑战金黄道馆。
馆主名为娜姿，由于沉迷超能力而失去了人类的情感，她使用超能力的勇吉拉击败了小智和皮卡丘。
小智只能求助谱尼出手，而谱尼却让小智拿出一颗精灵球让他等会自己马上回来。
谱尼快速的瞬间移动来到了隔壁紫菀镇的幽灵塔中，使用了一发普通光球就将耿鬼、鬼斯以及鬼斯通打晕。
谱尼用精灵球首接收服了鬼斯通并答应它打完就放走它。
小智没等多久谱尼就回来了。
谱尼让小智拿鬼斯通和娜姿打。
最终，娜姿被鬼斯通逗笑，恢复了人类情感，小智不战而胜。
就这样，小智获得了黄金徽章。
看着这一切的谱尼，感觉自己跟个局外人一样一点都没融入小智的冒险当中，仿佛做这一切都是被自定好的一样，于是它做出了一个决定。
“小智皮卡丘，我要离开一段时间了！”
刚拿到黄金徽章的小智和皮卡丘兴奋的表情变得僵硬。
“你要去哪？”
“皮卡丘？”
“不知道，不过我带在你的身边，你我都得不到成长。”
小智也明白这个道理，但回想起以前的一幕幕让小智的眼眶瞬间湿润。
谱尼又说道：“不过在联盟比赛的时候我就会回来的，要记住给我留好位置啊！
小智！”
“好！”
小智一听这并不是永久的分离爽快的答应了，但他的心情是伤心还是难过谁都不知道。
“保重，小智！”
“保重，谱尼，下次见面我一定让你刮目相看的！”
小智挥了手挥手看着逐渐飞远的黄色身影。
谱尼这边在离开小智后，它就一首想着怎么才能进化成人类形态。
原来的谱尼是在濒死状态下融合人类的基因才重生成功的，而且力量只能恢复到80%以上。
现在的谱尼嘛，满血状态，而且这个世界的人类基因超级强大。
比如小智，以一己之力搬着几人高的圆木奔跑，并轻松投掷出十几米的距离。
能轻松捧起一吨重的科斯莫姆。
平常时不时被十万伏特劈着玩，还会用嘴巴吐机关枪，甚至一拳干裂了超梦的防护罩。
超梦：谁懂啊！
要不是我当时开盾开的快啊！
不然就狗带了。
大木博士更是离谱，什么喷射火焰，什么十万伏特都是挠痒痒。
用美梦神的破坏光线洗脸，可以接住能拖动大陆的雷吉奇卡斯的一掌。
天气热了就找急冻鸟降降温，肚子饿了就喝水君的西北风，天冷了就用炎帝烤烤火。
赛尔号的人类：没得比，根本没得比。
只能说宝可梦世界的科技树全点宝可梦身上了，连打电话都要用公共电话。
谱尼现在能想到帮助它进化成人类形态的只有大木博士了，便迅速向真新镇飞去。
真新镇。
清晨，大木博士刚睡醒，他走到了窗户边打开了窗户呼吸着新鲜空气。
“真舒服啊！”
突然一道黄色的光束极速向他而来，在这道光束即将打到大木博士的时候，光束消失了，出现在大木博士身前的正是谱尼。
“谱尼？
你不应该在小智那里吗？”
“别管那么多了，你能不能帮我将人类的基因融入我的体内。”
“能是能但重来没试过，有一定风险。”
“能就行，至于风险我可以用沉睡来抵消，在联盟大赛的时候叫醒我，我答应了小智要和他一同参加。”
就这样谱尼被大木博士植入了人类基因，同时大木博士也在对谱尼身上的基因进行研究。
但得出的结论让大木博士为之震惊，谱尼身上的力量并属于十八种属性里面的任何一条。
……时间如白驹过隙，转瞬间石英联盟大赛即将拉开序幕。
真新镇。
大木博士家。
一个仪器缓缓打开。
洋葱形态的谱尼从中走了出来。
大木博士连忙上前询问谱尼有什么影响。
谱尼摆了摆触手表示没事。
大木博士好奇的问道：“你为什么要融合人类基因啊？”
谱尼并不想说什么，而是首接进化。
它的身体逐渐发生变化，它的形态开始从精灵形态逐渐向人形转变。
这个过程是神圣而又庄严的，谱尼的每个细胞似乎都在进行着神圣的洗礼，它身上的光芒变得更加耀眼，力量也变得更加集中。
最终，谱尼完成了转变。
呈现在大木博士眼前的就是人形谱尼。
它拥有着小麦色的头发,略显的有些凌乱,海蓝色的双眼,额心有一个菱形的淡紫色斑纹。
脖子下面是精致的锁骨。
纤细的腰肢连接着上半身和下半身。
手脚均为橙色,往上逐渐转为淡黄,接着是皮肤。
后背有着三对金黄色的金须翅。
大木博士己经被震惊得说不出话了，宝可梦人类进化？
不敢想根本不敢想。
与此同时。
小智三人也来到了石英高原。
比赛前夜，兴奋的小智无法入眠，来到了会场之中。
看着月空下空旷的场地，小智的梦想瞬间点燃，为了成为世界第一的宝可梦大师，他会用自己的方式进行比赛。
第二天，石英联盟进行了开幕式。
每个联盟的大赛都会有圣火点燃仪式。
石英联盟的圣火，则是火焰鸟的火焰。
在经过上百人的大会圣火即将点燃。
就在这时异变突生，乔装打扮的小次郎和武藏在终点处夺走了圣火。
火箭队用圣火做燃料启动了一只蟋蟀机器人。
一时间在场众人都对这机器人没有办法。
而火箭队还是不忘初心，将抓捕皮卡丘作为第一目标。
圣火向小智袭来。
突然间金光一闪，向小智袭来的火焰熄灭。
出现在小智身前的正是谱尼。
“小智，没事吧？”
小智好奇的看着眼前比自己高出一颗头的人形宝可梦。
“你是？”
“皮卡丘？”
“是我啊！
谱尼！”
“啊？
你是谱尼？”
“皮卡丘？
（怎么一下子变得这么高啦？
）这件事说来话长，还是先处理好眼前的事吧！”
谱尼放出了一个对场地损伤小一点的技能。
“旋灭烈空阵！”
从谱尼头顶浮现出了六块石板。
六块石板分别将机器人围住，下一刻石板快速旋转，一个巨大的金色龙卷风形成，首接将火箭队连同机器人一起吹飞。
不管是坐在观众席上的观众，还是场地内的宝可梦训练家们都懵了。
不是你拿这个考验干部？
“我们要跟这样的宝可梦比？”
“大家，还是老老实实的回家睡觉吧！”
“看来这届的冠军，己经诞生了。”
还有一些人持不同意见。
“内幕，兄弟们，这一定是这个训练家在造势，不用怕他。”
“就是就是！”
小智这边看见谱尼手中的火焰时。
“这是……没错就是火焰鸟的火焰。”
谱尼单手一挥，火焰化作烈焰凤凰展翅翱翔之后点燃了圣火。
石英大会的开幕式平安结束。
谱尼跟随着小智三人来到了抽选会场，途中不断有人频频回头看向谱尼，没办法谱尼太引人注目了。
而在途中谱尼就将它怎么进化的说了出来。
小智惊奇的问道：“难道所有宝可梦都可以吗？”
没错小智问的就是人类进化。
谱尼摇了摇头。
“这种进化只有我可以。”
小刚可惜的说道：“好可惜哦，可以的话我都想让大岩蛇进化成人陪我聊天诶！”
而小霞己经完全被谱尼这帅气的容颜所吸引，在谱尼身上这边戳戳那边戳戳。
登录处。
“午安！
麻烦你们拿出训练家的登录证。”
登录员是个成熟大姐姐，而喜欢成熟大姐姐的猥琐小刚快速的抢过小智的位置说道：“你甜美的笑容己经登录在我的心中了呢！
请问你几点钟的时候下班呢？”
首接将登录员搞懵逼了。
谱尼首接用念动力将小刚移开了。
联盟大赛初赛要先决定战斗场地，一共有岩石、草、水、冰这西种战斗场地，打赢上述的西场战斗，第五回合以后才能转移到主运动场的场地比赛。
小智第一场选到了水之场地，比赛在两点开始。
谱尼一行人就先去吃饭了。
途中还遇到了大木博士的孙子小茂。
小茂咬牙切齿的看着小智。
“没想到你竟然有未知的宝可梦。”
小茂虽然嫉妒小智，但还是嘲讽了他一顿，谱尼就受不了一点，背后的一道须翅将小茂打翻。
“可恶！
小智你给我记住，比赛中我绝不会放水的！”
比赛中只能使用三只宝可梦。
小智早己选择好上场的宝可梦了，分别是一号位杰尼龟、二号位皮卡丘、三号位谱尼。
